More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2889 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  48.53 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  43.21 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  41.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  29.37 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  41.79 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  39.19 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  38.36 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>