133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0144 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  44.24 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  40.87 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  39.6 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  34.93 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 194 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  46 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>