More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1862 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  44.59 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  47.37 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  36.47 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  32.52 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  42.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 280 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 258 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 106 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>