More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6679 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  35.23 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  35.23 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  50.88 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  34.62 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.03 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
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