More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3080 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  41.4 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  45.1 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0048  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  40.82 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 209 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>