More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3404 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  87.37 
 
 		 215 aa  347  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  52.58 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  51.78 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 213 aa  97.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
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NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  36 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
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