More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0252 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  40.84 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  37.37 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  32.5 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 245 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  56.86 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  31.06 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  51.61 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.47 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>