More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3188 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  81.68 
 
 		 205 aa  337  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  38.16 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.24 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  32.41 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 183 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.92 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  36.78 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  36.78 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4575  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.65 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.67 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  42 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>