285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3581 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  48.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 280 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  46.15 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>