More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9138 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 205 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  51.31 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  51.04 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  42.21 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  33.67 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  42.25 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  35.21 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.3 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.3 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  31.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>