227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2830 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  54.17 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  36.99 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>