179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11243 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  77.1 
 
 
228 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 
228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 
228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
220 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
218 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
247 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  47.74 
 
 
224 aa  191  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51 
 
 
230 aa  188  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 
254 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 
232 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  40.49 
 
 
219 aa  141  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
237 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
211 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  40.13 
 
 
205 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.1 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 
194 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
245 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
206 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.34 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.34 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
277 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
283 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
244 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
275 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  58.49 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  39.13 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  28.39 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  25.79 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>