More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  55.15 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.9 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.87 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 187 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
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NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  42.62 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
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NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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