More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1714 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  49.75 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.41 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
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NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  35.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  41.94 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  41.43 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 106 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  36.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
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NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
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NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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