More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10145 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 211 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 217 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 213 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.12 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.38 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.38 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.79 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.79 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.79 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.79 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  29.63 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  39.71 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  40.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
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NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
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NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 461 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
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NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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