More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0928 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 461 aa  947    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 231 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  30.21 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 200 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 		 216 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 184 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 223 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 250 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 214 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 226 aa  53.5  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 209 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 213 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 190 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 189 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 220 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 192 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 217 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 202 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 202 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 193 aa  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 206 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 209 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 224 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 215 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 205 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  25.38 
 
 		 227 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 205 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 198 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 218 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 239 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 235 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 202 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 218 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>