More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7226 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  27.84 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  49.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  52.94 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  29.8 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  44.93 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.62 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  48.08 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.77 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>