More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4369 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  51.24 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  36.96 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  41.46 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  27.37 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  34.48 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  26.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 125 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  54.35 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  43.68 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  47.54 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>