More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1640 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  83.8 
 
 		 215 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  32.4 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.96 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.73 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.49 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.1 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  25 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>