More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4729 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  38.64 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  29.67 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
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NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
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NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
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NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  44.83 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
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NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
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