More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1780 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  91.04 
 
 
201 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  67.53 
 
 
208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  63.4 
 
 
207 aa  241  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  63.4 
 
 
207 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
205 aa  214  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
203 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 
204 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  52.28 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 
209 aa  188  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 
204 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 
196 aa  184  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 
201 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 
202 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
204 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 
202 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
208 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
196 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  31.48 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
205 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 
243 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  34.34 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  32.94 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
204 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  33.92 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  23.12 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  39.33 
 
 
101 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
240 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
211 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
204 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.63 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
255 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
241 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
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NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
217 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
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NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
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