More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2575 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  20.51 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.61 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>