More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3253 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  92.27 
 
 		 194 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  85.57 
 
 		 194 aa  343  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  85.05 
 
 		 194 aa  339  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  20.85 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 254 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  22.6 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.75 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  22.14 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  18.48 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 310 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 268 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>