154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4896 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  72.68 
 
 		 184 aa  278  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  72.13 
 
 		 184 aa  275  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  73.03 
 
 		 210 aa  270  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  70.79 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  23.9 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  23.9 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 204 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  20.94 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.12 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  24.86 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  24.86 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  25 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  20.94 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  38.6 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.93 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  37.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2533  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  37.1 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  37.14 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  38 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  40 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  27.49 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1327  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.043408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  27.49 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>