92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  36.21 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  29.85 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  38 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  28.78 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  37.25 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  32.84 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  21.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  39.34 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  32.31 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0698  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 194 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.47 
 
 		 177 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1766  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  34.15 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>