29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1327 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1327  transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.043408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  27.49 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  30.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  19.7 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  20.49 
 
 		 235 aa  42  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 185 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  22.37 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>