166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2357 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  34.1 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  32.37 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 219 aa  88.2  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  29.94 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  30.81 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  27.93 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  23.49 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  46.58 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  26.99 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  25.28 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  25.93 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  41.54 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  28.05 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>