139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  39.73 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  42.11 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  44.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  44.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  46.27 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  43.14 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  40.82 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  42 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  41.27 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  32.88 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  42.59 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  28.78 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  38.78 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  39.62 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>