More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04830 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  65.14 
 
 		 219 aa  292  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  30.95 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.84 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.92 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  22.63 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  22.65 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  22.65 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  25.41 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  32.32 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  25.26 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  26.35 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  27.13 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 179 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 184 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  19.57 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 184 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  24.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  21.32 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  24.29 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>