94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0966 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  25.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  23.08 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.79 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  23.73 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.17 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  21.12 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  21.34 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18600  hypothetical protein  23.17 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.989608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.3 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  19.89 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  21.74 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  22.62 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  24.03 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 423 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 225 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  42  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  31.03 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  26.83 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  21.67 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  40 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  34.29 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>