110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  28.8 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  21.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  21.71 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  28.07 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  26.83 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  21.74 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.65 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  37.35 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  47.73 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1447  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.456652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  20.79 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  36.21 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  36.07 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18600  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.989608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.11 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  30.36 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  36.07 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 184 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>