143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0461 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 177 aa  84.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.44 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  26.85 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  23.7 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  23.37 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  24.86 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  25.6 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  29.31 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  19.53 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  25.24 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  24.73 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  18.04 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  22.02 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  29.73 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  23.56 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.76 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.28 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  36.54 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  18.18 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>