163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0956 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  22.95 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  33.62 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  29.34 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  36.99 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.28 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  22.35 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  27.17 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  21.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  25.61 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0300  TetR/AcrR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 274 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  20.54 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  23.31 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  23.38 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  25.14 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  22.73 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  29.31 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>