118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04470 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  67.4 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  47.13 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  27.22 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  21.95 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  22.89 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  25.15 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  22.89 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  22.42 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  22.42 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  22.89 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  37.35 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  44.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  23.31 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  21.51 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  24.22 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1714  hypothetical protein  21.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  24.34 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  34 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.48 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  33.93 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  34 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  38.3 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  38 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  21.82 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 191 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>