201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1648 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  353  6.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  44.09 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  44.09 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  44 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  44.09 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  44.09 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  44.09 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  38.89 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  26.81 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  28.97 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.79 
 
 		 289 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  29.49 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  33.67 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  33.67 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  32.31 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  25.56 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  32.22 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  38.78 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  24.77 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 260 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  31.13 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>