249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1367 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  62.78 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.73 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  23.78 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.31 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  38.75 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  23.89 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  22.91 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 249 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  32.56 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  17.49 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  42.11 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 302 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  24.74 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  24.74 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 244 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  21.74 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  45.76 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>