More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2544 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  62.78 
 
 		 181 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  31.73 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.32 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.18 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  27.68 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  31.5 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  48.21 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  25.84 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  28.57 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  23.32 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  21.55 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  26.2 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 249 aa  51.2  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  24.57 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  26.78 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  25.65 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>