265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0727 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 217 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 288 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 257 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 290 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  31.78 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 388 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>