131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3306 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  100 
 
 		 189 aa  359  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4203  TetR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4269  TetR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4430  TetR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  21.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 299 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 225 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  22.58 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 469 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.36 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.46 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>