More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5881 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  33.09 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.77 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  32.18 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 357 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  32.84 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 342 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  28.48 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  32.35 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>