More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  43.53 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.32 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  39 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  34.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  35.35 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 244 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.49 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  57.41 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>