165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2981 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  34.84 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  32.9 
 
 		 207 aa  94.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  32.26 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  36 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 199 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  27.07 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
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NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  31.18 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  34.59 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  30.56 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  28.23 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 215 aa  47.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  36.21 
 
 		 219 aa  44.3  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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