101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3251 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  43.02 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 180 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 185 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 180 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 182 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  31.61 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  32.61 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  37.14 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  26.24 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 194 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 233 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 238 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
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