96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4460 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  75.94 
 
 		 187 aa  278  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.34 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  39.66 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  33.55 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  32.72 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  26.88 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  24.44 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  34.65 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  34.48 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 212 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  37.78 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
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NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
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