70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3310 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  84.39 
 
 		 207 aa  327  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  84.39 
 
 		 207 aa  327  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  52.68 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 123 aa  171  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 231 aa  150  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.73 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  29.86 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  31.06 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  28.21 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
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