164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1872 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  45.68 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  40.26 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  35.2 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  33.13 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  36.91 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  31.76 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  27.34 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  19.78 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.42 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>