48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5723 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  42 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  35.19 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  44.68 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 209 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 188 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 214 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
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NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 210 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
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