74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2656 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  36.48 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.65 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  31.06 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  25.27 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 219 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 208 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  28.47 
 
 		 219 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  36.36 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
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