133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1479 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  37.2 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  31.18 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 123 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 180 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  29.05 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 188 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 182 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.62 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  25.62 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  29.91 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  20.62 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  24.16 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  27.78 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  27.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  27.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>