93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1595 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  96.88 
 
 		 192 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 187 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  40 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.58 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 179 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  25.13 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  26.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  34.64 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  33.98 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  27.66 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 197 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  28.95 
 
 		 209 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 189 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 211 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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